El colega Algabe en el irc en freenode me recomendó esta utilidad.
Cumple con la sencillez de comparar 2 archivos.

Recomendado.

sudo apt-get install diffuse

en ubuntu o similares para instalarlo.

Este comando es muy importante; cuando se reinicia el sistema de la forma inadecuada apretando reset del gabinete, o apagándose pueden producirse daños en nuestro sistemas de archivos.
Esto hace que aveces no nos deje iniciar a nuestro sistema.
Algunos sistemas hace un chequeo cada determinado tiempo, esto es interesante no abortar esta prueba.

Imaginemos que tenemos un archivo de 20mb y lo queremos subir a el hosting de Google sites...Pero este solo acepta archivos menos de 11mb.

En ubuntu y debian esto es muy facil de resolver, como?, dividiendo en 2 a los archivos. Asi:

cd carpeta_contenedora

dividimos los archivos:

split -b10m archivo.tar.gz archivo-

siendo:

• -b10m el tamaño de los archivos dividos
• archivo.tar.gz el archivo de entrada. Y
• archivo- el nombre de los archivos de salida (archivo-aa archivo-ab archivo ac etc)

Ya me a tocado usar el testdisk y explicado para que lo usen... que es muy bueno para recuperar algunos archivos "perdidos" que por error o un mal uso del SO han sido eliminados.

Ahora toca el turno de esta aplicación gráfica, bastante mas completa y para todos los archivos perdidos. Sistema de archivos soportados (NTFS, FAT, FFS, EXT2FS, y EXT3FS)